Khoản 1, 5 Điều 76 Thông tư 38/2015/TT-BTC được sửa đổi, bổ sung tại khoản 52 Điều 1 Thông tư 39/2028/TT-BTC quy định thủ tục hải quan đối với trường hợp DN chế xuất thuê DN nội địa gia công thì: “hàng hóa do DN chế xuất DN nội địa gia công: DN nội địa làm thủ tục hải quan theo quy định về gia công hàng hóa cho thương nhân nước ngoài quy định tại mục 1, 2 chương III thông tư này. Riêng về địa điểm làm thủ tục hải quan, DN nội địa được lựa chọn thực hiện tại chi cục hải quan quản lý DN chế xuất. Khi khai chỉ tiêu thông tin “số quản lý nội bộ DN” trên tờ khai hải quan, DN nội địa phải khai như sau: GCPTQ; DN chế xuất không phải làm thủ tục hải quan khi đưa hàng hóa vào nội địa để gia công và nhận lại sản phẩm gia công từ nội địa… Các trường hợp không làm thủ tục hải quan tại điều này, DN chế xuất có trách nhiệm lưu giữ và xuất trình các chứng từ tài liệu liên quan đến hoạt động gia công, sản xuất hàng XK theo quy định tại Điều 60 Luật Hải quan, Điều 37 Nghị định 08/2015/NĐ-CP (trừ việc thông báo cơ sở sản xuất)”.

Trường hợp DN chế xuất thuê DN nội địa gia công tái chế phế liệu thu được trong quá trình sản xuất để tái sử dụng thì DN nội địa làm thủ tục hải quan theo quy định về gia công cho thương nhân nước ngoài, DN chế xuất không phải làm thủ tục hải quan nhưng có trách nhiệm lưu giữ và xuất trình các chứng từ tài liệu liên quan đến hoạt động gia công, sản xuất hàng XK theo quy định của pháp luật.

Về chính sách thuế, tại khoản 2 Điều 2 Luật Thuế XK, thuế NK quy định hàng hóa XK từ thị trường trong nước vào khu phi thuế quan, hàng hóa NK từ khu phi thuế quan vào thị trường trong nước thuộc đối tượng chịu thuế.

Khoản 1 Điều 4 Luật Thuế XK, thuế NK cũng quy định khu phi thuế quan là khu vực kinh tế nằm trong lãnh thổ Việt Nam, được thành lập theo quy định của pháp luật, có ranh giới địa lý xác định, ngăn cách với khu vực bên ngoài bằng hàng rào cứng, bảo đảm điều kiện cho hoạt động kiểm tra, giám sát, kiểm soát hải quan của cơ quan Hải quan và các cơ quan có liên quan đối với hàng hóa XNK và phương tiện, hành lý XNC, quan hệ mua bán, trao đổi hàng hóa giữa khu phi thuế quan với bên ngoài là quan hệ XNK.

Khoản 4 Điều 26 Nghị định 35/2022/NĐ-CP của Chính phủ quy định quan hệ trao đổi hàng hóa giữa DN chế xuất với các khu vực khác trên lãnh thổ Việt Nam, không phải là khu phi thuế quan, là quan hệ XNK.

Căn cứ vào các quy định hiện hành về đối tượng chịu thuế tại Luật Thuế XK, thuế NK thì trường hợp DN nội địa (không nằm trong khu phi thuế quan) XK hàng hóa từ thị trường trong nước vào DN chế xuất thì phải chịu thuế XK. Trường hợp DN nội địa (không nằm trong khu phi thuế quan) NK hàng hóa từ DN chế xuất vào thị trường trong nước thì phải chịu thuế NK./.